Rubicon介紹與報價

PicoPLEX®產品系列：單細胞全基因組擴增試劑

ThruPLEX®產品系列：全基因組測序、全外顯子測序、靶向測序、ChIP-Seq、ctDNA、CNV、染色體異倍性分析的文庫構建

Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國密歇根州。產品都擁有技術，檢控嚴格，擁有cGMP級生產能力，有多個OEM合作伙伴，是單細胞測序文庫構建的。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員，并且發展良好。

Rubicon 試劑訂購信息

華雅再生醫學旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術有限公司2018年與TAKARA繼續合作，授權代理（上海）Rubicon和Cellartis 試劑。紅榮微再以“傳遞科學價值，服務科學研究”為宗旨，主營干細胞、精準醫療、細胞治療、器官再生四大板塊的產品。

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Rubicon擁有ThruPLEX®和PicoPLEX®技術。特殊的引物或接頭設計，能以微量DNA樣本起始構建下一代測序文庫。

Rubicon ThruPLEX和所有illumina NGS平臺兼容。ThruPLEX DNA-seq Kit是通用性較高的試劑盒，適合全基因組測序、全外顯子測序、靶向測序和ChIP-Seq的文庫構建。

ThruPLEX Plasma-seq是血漿游離DNA的試劑盒，適用液體活檢相關（循環腫瘤DNA和無創產前檢測：母體血漿胎兒游離DNA）的基因文庫構建。

ThruPLEX Tag-seq Kit能提供1600萬以上的分子標簽（Unique Molecular Tags），結合靶向序列富集系統，適合稀有變異等位基因檢測。

Rubicon PicoPLEX 采用技術，設計優化用于從單細胞中擴增全基因組DNA，適用植入前胚胎基因篩查和診斷（PGS，PGD）。

PicoPLEX WGA Kit不能直接應用NGS，PicoPLEX DNA-seq Kit可以直接應用illumina NGS平臺。

PicoPLEX®產品系列

產品概述 PicoPLEX WGA kit采用技術，設計、優化用于從單細胞中擴增單拷貝基因組DNA。便捷的單管操作流程減少了手動操作的失誤，縮短了獲得結果的時間并降低背景。PicoPLEX WGA Kit同樣也可用于6 pg至50 pg的純化gDNA，并兼容微陣列比較基因組雜交（array CGH）分析及PCR，不能直接應用NGS。PicoPLEX WGA Kit被IVF行業供應商如BlueGnome信賴并用于胚胎植入前遺傳學篩查和診斷(PGS/PGD)。

PicoPLEX® DNA-Seq Kit簡化了文庫制備的過程；整個制備過程可在單管或單孔中完成，降低了錯誤和樣品污染的概率，加速了實驗進程，并且削減了實驗成本。PicoPLEX® DNA-Seq Kit具有48次反應規格，具備完整的48個單獨細胞或DNA（6 pg至60 pg）起始的NGS文庫構建試劑，包括dual Barcodes。單微孔板中含有Barcoding Oligonucleotides。

PicoPLEX® WGA Kit特點

· 可以單細胞（或<15 pg DNA）起始獲得可重復結果

· 出色的等位基因重復性

· 易于使用和自動化

· 清晰的實驗結果，不論微陣列還是PCR

PicoPLEX® DNA-seq Kit 特點

· 高再現性：拷貝數變異（CNV）及染色體異倍性檢測重復性高

· 完整的文庫構建試劑：包含所有文庫構建所需試劑

· 簡便的工作流程：從單細胞到測序可用文庫僅需三步

· 快速：3小時內完成Illumina NGS文庫構建

· 低污染、低錯誤發生率：單管內完成文庫構建，無需轉移

PicoPLEX®技術概要

PicoPLEX®技術相比于以往的PCR、MDA、MALBC為基礎的單細胞全基因組擴增技術，操作簡單，擴增重復性良好。特別設計的隨機引物（參見US patent 8,206,913）能減少引物二聚體的形成，從而提高引物和模板的配對效率。

分兩次擴增。

*次擴增，特殊隨機引物與基因組DNA結合，形成莖環結構文庫。

第二次擴增，只有莖環結構的文庫被擴增

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ThruPLEX® 產品系列

產品概述 ThruPLEX DNA-seq Kit 基于新的ThruPLEX 技術，可以低至50 pg的DNA起始構建DNA文庫，在提高靈敏度的同時可以構建多達96種檢索引物文庫。本試劑適用于多種樣品來源的片段化DNA樣品，基因組DNA或體液樣品如游離DNA，FFPE樣品來源DNA和cDNA。ThruPLEX DNA-seq Kit 整體流程可以在單管或單孔中進行，約2個小時即可完成，無需純化或樣品轉移步驟。試劑盒提供12、48或96種Illumina單端或雙端檢索引物，該系列引物保存在反應管中(6或12)或預分裝密封于條形碼標記的微孔板中。ThruPLEX DNA-seq Kit 可以用于DNA-seq，RNA-seq，ChIP-seq，并且可以兼容主流平臺實現強有力的目標區域富集。

ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標簽（UMT）的ThruPLEX引物構建帶有分子標記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫。每個試劑盒包含超過1,600萬個特別序列用于在擴增前標記每條DNA fragment，可以在文庫制備、目標富集和數據分析過程中追蹤DNA fragment，以檢測低豐度等位基因或計數獨立片段。采用ThruPLEX 技術設計及優化，可以1到50 ng DNA起始構建高多樣性、高重復性文庫。整個流程在單管或單孔中就可完成，只需3步，2小時，無需中間純化步驟和樣品轉移，避免了操作誤差和樣品損失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑，包括可以多重標記96個樣品的檢索引物。純化和定量后，文庫可以采用標準Illumina測序試劑和流程在Illumina NGS平臺進行測序。

ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術，并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。

該試劑專門針對cfDNA進行優化，在保持樣本GC代表性的基礎上，提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫，能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液態活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價值高的特點，深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

產品特點

ThruPLEX® DNA-seq Kit

· 高靈敏度、高性能：以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料。

· 完整的文庫構建試劑：優化的檢索引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無核酸酶水。

· 快速簡便的工作流程：單管或單孔3步操作，2小時，無需轉移操作。

· 兼容主流目標區域富集平臺：Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes。

ThruPLEX® Tag-seq Kit

· 可信賴的實驗結果。ThruPLEX Tag-seq 技術提供了多達1,600萬個分子標簽來糾正測序誤差，提供可信的變異檢測分析。

· 發現更多，成本更低。結合基于雜交技術的目標序列富集系統可分析數百個基因，同時分析突變和結構變異。

· 每次都可獲得高質量文庫。單管操作，2小時，3步操作流程。使用簡便，可減少使用者操作誤差和污染發生。

· 省時的生物信息學分析方案。采用Curio Genomics提供的云服務軟件或開源軟件可以快速獲得研究結果。

· 珍貴樣品分析成為可能。更低的DNA起始量，以往由于起始量太低而不能分析的樣品也可以分析了。ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始，兼容多種樣品類型。

ThruPLEX® Plasma-seq Kit

· 專為cfDNA設計：經過優化的修復及連接試劑。

· 高品質NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內，可以達到高檢測再現性。

· 起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量。

· 快速簡便：無需純化或樣品轉移的單管、2小時、3步操作步驟。

· 應用領域：液態活檢、ctDNA、目標區域測序等領域文庫構建。

· 兼容自動化平臺：Beckman® FXP Workstation。

ThruPLEX®技術概要

*莖環接頭（參見US patent 7,803,550），接頭5’端的封閉設計能夠有效抑制二聚體的形成。連接后未反應的接頭無需純化，就被降解。因此反應具有高靈敏度和低背景的特點。

后續擴增步驟，引物包含illumina測序*寡核苷酸。Illumina*SBS（邊合成邊測序）技術，高通量文庫制備時樣本DNA需要插入寡核苷酸作為illumina index。

莖環形接頭的特別設計，免去了大多數illumina等文庫制備技術需要的中間純化和樣本轉移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應管、2個小時、3步反應的簡單過程。僅在PCR反應后進行1次磁珠純化，純化造成的樣本損失低，可對珍貴樣本進行有效分析。

Rubicon ThruPLEX®和PicoPLEX®兩種技術都有*的自配對莖環形DNA fragment，能減少基因擴增時假陽性、假陰性和非特異性擴增的發生。

紅榮微再精準醫療產品手冊

華雅再生醫學旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術有限公司2018年與TAKARA繼續合作，授權代理（上海）Rubicon和Cellartis 試劑。

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