華雅旗下紅榮微再授權代理TAKARA Rubicon 文庫構建（illumina平臺）產品

Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit

ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

產品英文名稱：ThruPLEX® Plasma-seq Kit

產品中文名稱：血漿來源cell free DNA NGS文庫構建試劑

樣本：血漿來源的cfDNA（cell free DNA）和ctDNA（循環腫瘤DNA）

用途：WGS，WES，靶向測序，ctDNA分析

ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術，并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫（illumina平臺）構建。

該試劑專門針對cell-free DNA進行優化，在保持樣本GC代表性的基礎上，提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。

血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫，能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液體活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價值高的特點，深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

產品特點

專為cfDNA設計：修復及連接試劑配方更新，方法優化

高品質NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內，可以達到高檢測再現性

起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量

快速簡便：單管、2小時、3步操作步驟，無需純化或樣品轉移步驟

應用領域：液體活檢、ctDNA、靶向測序等領域文庫構建

兼容自動化平臺：Beckman® FXP Workstation

ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols

High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage

Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA

Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps

Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing

Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation

產品應用

WGS，WES，靶向測序，ctDNA分析

cfDNA文庫構建，腫瘤及產前無創檢測（母體血漿中胎兒游離DNA分析）

ThruPLEX Plasma-seq 優化用于cell-free DNA等液體活檢樣品

液體活檢樣品包括

循環核酸

– Cell-free DNA (cfDNA)

• 循環腫瘤DNA（ctDNA）占一小部分

及RNA 外泌體等

ThruPLEX技術原理

ThruPLEX技術和所有Illumina NGS平臺兼容。

技術要點：莖環形接頭

莖環形接頭的特別設計，免去了大多數Illumina等文庫制備技術需要的中間純化和樣品轉移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應管、2個小時、3步反應的簡單過程。僅在PCR反應后進行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對珍貴樣品進行有效分析。

產品使用

適用樣本：液體活檢樣本

1ng-30ng 血漿、尿液來源的cfDNA

組份 

分模板準備、文庫合成和文庫擴增三大部分。保存-20℃。

Template Preparation Buffer 模板準備緩沖液（紅色）

Template Preparation Enzyme 模板準備酶（紅色）

Library Synthesis Buffer文庫合成緩沖液（黃色）

Library Synthesis Enzyme文庫合成酶（黃色）

Library Amplification Buffer文庫擴增緩沖液（綠色）

Library Amplification Enzyme文庫擴增酶（綠色）

Nuclease-Free water 無核酸酶水（無色）

Indexing 試劑（藍色）

咨詢 1500 1904 520 紅榮微再-客服: 經銷商專員

自備材料：

PCR管或96孔PCR板和密封件

Low binding aerosol barrier tips

新鮮制備的80％（v / v）乙醇

Agencourt® AMPure® XP 磁珠（Beckman Coulter，目錄號A63880）

可選試劑：

KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)

EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)

Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories

簡單的工作流程：一管反應

樣品加入PCR管。

準備模版修復混合液1（紅蓋），加入PCR管，反應。

準備文庫合成混合液2（黃蓋），加入PCR管，反應。

準備文庫擴增混合液3（綠蓋），加入PCR管，反應。

產品性能

高cell-free DNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫，具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品，文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序，且每個文庫產生17 M到25 M reads。每個文庫在down-sampling數據至17 M reads以后，計算Duplication rates。

Rubicon R400490/R400491/R400492 訂購信息

Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國密歇根州。產品都擁有技術，檢控嚴格，擁有cGMP級生產能力，是單細胞測序文庫構建的。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員，并且發展良好。

華雅再生醫學旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術有限公司主營細胞治療和精準醫療等產品，2018年與TAKARA繼續合作，授權代理（上海）其旗下Rubicon單細胞文庫構建試劑等產品。