產品名稱：NextSeq 500/550 Mid Output v2 kit (150 cycles)

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產品貨號：FC-404-2001

適用系統：illumina NextSeq 500, NextSeq 550測序儀

產品介紹：

在 NextSeq 500/550上執行測序運行需要使用一次性 NextSeq 500/550試劑盒。每個試劑盒包含一個流動槽和一次測序運行所需的試劑。流動槽、試劑夾盒和緩沖液夾盒均使用射頻識別（radio-frequency identification，簡稱RFID）進行精確的耗材跟蹤并確保兼容性。 

NextSeq 500/550 v2測序試劑盒將高通量測序系統的功能整合到臺式計算機中，不僅改善了數據質量，而且使無錯誤片段產率達到zui高水平。此試劑盒具有下列優點：出色的堿基檢出，提升的信噪比

提供多種測序輸出和片段長度選擇方案

試劑夾盒配置簡化，工作流程和夾盒上樣改善

提供直觀標記和RFID編碼試劑

采用的邊合成邊測序(SBS)和橋式擴增簇生成技術，優化化學過程

此試劑盒不僅提供強大的測序化學過程，而且將手動操作時間壓縮至短短10分鐘。直觀標記和RFID編碼試劑確保與用戶自定義的運行配置兼容。

（NextSeq 500/550 v2套件已于2018年12月31日停產; 出貨量持續到2019年2月28日。TG版本不受影響。NextSeq 500/550 v2.5套件是替代產品，與v2套件相比，具有更高的穩定性和堅固性。）

產品名稱：illumina NextSeq 500/550 v2基因測序試劑盒(150 cycles)        產品貨號：FC-404-2001

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illumina主要的全基因組測序方法

大型全基因組測序

測序大型基因組（> 5 Mb），如人類、植物或動物基因組，為疾病和群體遺傳學研究提供寶貴信息。

小型全基因組測序

小型基因組測序（≤ 5 Mb）包括測序細菌、病毒或其他微生物的整個基因組。無需培養細菌，研究人員可利用NGS平行測序數千個小生物。

De Novo 測序

De novo測序是指在沒有參考序列的情況下，對一個新的基因組進行測序。NGS能實現對任何物種的快速、準確鑒定。

Phased基因組測序

Phased測序，又稱基因組Phased。通過區分同源染色體的等位基因差異而獲得全基因組單體型，該信息通常對遺傳疾病的研究至關重要。

背景知識：

全基因組測序概述

全基因組測序可謂是基因組zui為全面的研究方案。基因組信息已能用于鑒定遺傳疾病，查找驅使癌癥發展的突變，追蹤疾病的爆發。illumina迅速下降的測序成本以及處理大樣本數據能力的提升都使得如今的測序者可將全基因組測序視為基因組研究的zui強有力工具。

全基因組測序常被理解為用于測定人類基因組，然而illumina新一代測序技術(NGS)的規模、靈活性體現于可以在任何物種上運用測序技術，如農業畜牧業，植物，或疾病相關微生物。

illumina全基因組測序的優點

提供高分辨率、到逐個堿基的基因組視圖

可捕獲大的變異，以及小到可能被遺漏的變異

鑒定潛在的致病變異，從而進行基因表達和調控機制的進一步研究

在短時間內提供大量的數據，以支持新基因組的組裝

呈現基因組視圖

外顯子組測序或靶向重測序等有側重點的方法只分析基因組的有限部分，全基因組測序則不同，能提供整個基因組的全面視圖。它是各種發現應用——如鑒定致病變異和新基因組組裝——的理想選擇。全基因組測序可檢測單核苷酸變異、插入/缺失、拷貝數改變和大的結構變異。隨著技術創新，的基因組測序儀能夠比以往更地開展全基因組測序。

單端測序：單端測序(Single-read)首先將DNA樣本進行片段化處理形成200-500bp的片段，引物序列連接到DNA片段的一端，然后末端加上接頭，將片段固定在flow cell上生成DNA簇，上機測序單端讀取序列。

雙端測序：雙端測序(Paired-end)方法是指在構建待測DNA文庫時在兩端的接頭上都加上測序引物結合位點，在*輪測序完成后，去除*輪測序的模板鏈，用對讀測序模塊(Paired-End Module)引導互補鏈在原位置再生和擴增，以達到第二輪測序所用的模板量，進行第二輪互補鏈的合成測序。

cDNA文庫：以mRNA為模板，經反轉錄酶催化，在體外反轉錄成cDNA，與適當的載體(常用噬菌體或質粒載體)連接后轉化受體菌，則每個細菌含有一段cDNA，并能繁殖擴增，這樣包含著細胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱為該組織細胞的cDNA文庫。cDNA文庫特異地反映某種組織或細胞中，在特定發育階段表達的蛋白質的編碼基因，因此cDNA文庫具有組織或細胞特異性。

cDNA文庫是以特定的組織或細胞mRNA為模板，逆轉錄形成的互補DNA(cDNA)與適當的載體(常用噬菌體或質粒載體)連接后轉化受體菌形成重組DNA克隆群，這樣包含著細胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱為該組織或細胞的cDNA文庫。cDNA文庫特異地反映某種組織或細胞中，在特定發育階段表達的蛋白質的編碼基因，因此cDNA文庫具有組織或細胞特異性

cDNA文庫顯然比基因組DNA文庫小得多，能夠比較容易從中篩選克隆得到細胞特異表達的基因。但對真核細胞來說，從基因組DNA文庫獲得的基因與從cDNA文庫獲得的不同，基因組DNA文庫所含的是帶有內含子和外顯子的基因組基因，而從cDNA文庫中獲得的是已經過剪接、去除了內含子的cDNA。

真核生物基因組DNA十分龐大,其復雜程度是蛋白質和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重復序列. 采用電泳分離和雜交的方法,都難以直接分離到目的基因.這是從染色體DNA為出發材料直接克隆目的基因的一個主要困難。

高等生物一般具有10^5種左右不同的基因,但在一定時間階段的單個細胞或個體中,都僅有15%左右的基因得以表達,產生約15000種不同的mRNA分子.可見,由mRNA出發的cDNA克隆,其復雜程度要比直接從基因組克隆簡單得多。

cDNA文庫在研究具體某類特定細胞中基因組的表達狀態及表達基因的功能鑒定方便具有特殊的優勢，從而使它在個體發育、細胞分化、細胞周期調控、細胞衰老和死亡調控等生命現象的研究中具有更為廣泛的應用價值，是研究工作中較常使用到的基因文庫。

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